美國Bd 單細胞分析系統(tǒng) Rhapsody TM

產(chǎn)品介紹

當(dāng)對序列讀取進行計數(shù)時，PCR擴增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。BD的分子標(biāo)簽技術(shù)為單個細胞的單個基因分配了的分子索引，也稱為“分子條形碼"。實驗者可借此克服擴增偏差，更準(zhǔn)確地計算轉(zhuǎn)錄水平。



系統(tǒng)組件包括

。BD Rhapsody 掃描儀

。BD Rhapsody 上樣臺

。BD Rhapsody 卡片芯片

。分子標(biāo)簽試劑和文庫制備

。特定應(yīng)用的靶向檢測試劑盒（pancl)

為您的實驗定制工作流程

對于不同用戶和實驗，單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項可以根據(jù)具體需求進行配置。BD FACS分選機（如BD FACSMelody ）是BD Rhapsody系統(tǒng)上游樣本富集的良好選擇。BD Rhapsody掃描儀提供自動化細胞計數(shù)和細胞樣本活性測試，幫助用戶制備適用于卡式芯片單細胞捕獲的濃度的樣本。掃描儀提供了卡式芯片上微球捕獲細胞的計數(shù)。BD Rhapsody上樣臺輕巧便攜，可在實驗室內(nèi)輕松移動。同樣還提供生物信息學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括UMI分析算法和可視化工具，即使沒有經(jīng)驗的用戶也可分析和理解單細胞數(shù)據(jù)。

數(shù)千個單細胞數(shù)百個基因的平行分析

單線胞RNAscq正在改變我們對細胞的理爭。BD Rhapsody TM 單細胞分析系弘基于BD在細胞生物學(xué)領(lǐng)域40年的專業(yè)技術(shù)，滿足您的實驗需求，在單細胞水平理解細胞形態(tài)和功能。

這種全新的分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性，例如，微陣列和大量細胞RNAscq,這些檢測通過實驗對各個細胞之間的微妙差異的觀察，依賴于對多個細胞的平均檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細胞類型。其進一步幫助理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等各個領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過程。

BD Rhapsody 單細胞分析系統(tǒng)能對成千上萬個單細胞的數(shù)百個基因進行數(shù)字定量，提供足夠靈活的定制測定法以滿足任何實驗需要，其有效系統(tǒng)可縮短實驗時間和降低測序成本。

使單細胞測序效率更高

靶向方法對單細胞分析的益處通過使用競爭產(chǎn)品的WTA測定和BD Rhapsody免疫反應(yīng)組合（panel）（人）在相似的測序深度下對外周血單核細胞（PBMC）進行表達譜分析來證明。雖然兩種測定方法的t-SNE表達譜分析都顯示了已知PMBC細胞類型的聚類結(jié)果，靶向組合（panel）顯示了比WTA更高的靈敏度（讀數(shù)/細胞）和UMI計數(shù)效率。BD Rhapsody測定實現(xiàn)了與競品WTA測定類似的聚類性能，而測序讀數(shù)降低了近10倍（靶向讀數(shù)2k vs. WTA讀數(shù)20k）。與使用WTA方法不同，靶向組合（panel）避免了對多個高表達基因的測序如核糖體蛋白或低表達變異性，從而提高測定效率。

更有效的測序可以更低的成本實現(xiàn)更高的通量

由于與高通量實驗方法相關(guān)的測序成本，單細胞實驗往往非常昂貴。BD Rhapsody單細胞分析系統(tǒng)設(shè)計有多個功能，可以更有效地利用測序來降低實驗成本。

· 靶向測定-由于檢測靈敏度的提高，特定的基因組合方法可使用少量的時間和成本，幫助產(chǎn)生類似于全轉(zhuǎn)錄組分析（Whole Transcriptome Analysis，WTA）測定的結(jié)果。這種方法還提高了UMI計數(shù)效率，從而極大程度的節(jié)省了實驗時間和成本。

· 儲存-從樣本中得到的完整cDNA可在磁性微球上穩(wěn)定存儲，允許將珍貴樣本保存長達16周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進行測序，并通過對儲存的微球池進行等分或分樣來實現(xiàn)同一樣本的多個測定。

· 分樣—在磁性微球上儲存的cDNA A可以分成一個或多個等分試樣，并使用定制或預(yù)先設(shè)計的組合（panel）進行擴增。通過提供對部分樣本進行測序的選項和對樣本不同組合（panel）進行測試的靈活性，分樣可降低成本。